1980 और 1990 के दशक आजाद भारत के इतिहास के सबसे काले अध्यायों में से एक हैं। 1971 के युद्ध में अपनी पराजय और अपने पूर्वी पाकिस्तान के बांग्लादेश बनने के बाद, पाकिस्तान ने भारत के विरुद्ध  सीधी लड़ाई छोड़ दी। अब उसने भारत को आंतरिक रूप से अस्थिर करने के लिए K2 (कश्मीर-खालिस्तान) रणनीति अपनाई। पंजाब में अलगाववादी हिंसा को बढ़ावा दिया, जबकि कश्मीर में कश्मीरी पंडितों का बेरहमी से जातीय सफाया किया गया। 

पाकिस्तान प्रायोजित आतंकवाद से बढ़ते नुकसान के बावजूद, अमेरिका ने भारत की चिंताओं को सिर्फ ‘कानून और व्यवस्था’ का मामला बताकर खारिज कर दिया। पर 1999 में IC-814  जहाज के अपहरण ने कुछ समय के लिए वाशिंगटन को झटका दिया, जिससे दोनों देशों भारत और अमेरिका के बीच सन् 2000 में सीमित आतंकवाद विरोधी सहयोग हुआ।